一、linux图形界面的实现只是linux下的应用程序实现
图形界面（GUI）并不是linux的一部分，linux只是一个基于命令行的操作系统，linux和Xfree的关系就相当于当年的DOS和Windows 3.0一样，Windows 3.0不是独立的操作系统，它只是DOS的扩充，是DOS下的应用程序级别（GUI）的系统，不是独立的操作系统。同样XFree只是linux下的一个应用程序而已，不是系统的一部分，但是X的存在可以方便用户使用电脑。Windows 95及以后的版本就不一样了，他们的图形界面是操作系统的一部分，图形界面在系统内核中就实现了，没有了图形界面windows就不成为windows了，但linux却不一样，没有图形界面linux还是linux，很多装linux的WEB服务器就根本不装X服务器。这也WINDOWS和linux的重要区别之一.
二、X是协议，不是具体的某个软件
X是协议，就像HTTP协议、IP协议一样。因为输入设备和显示设备不是同一个设备，而且他们需要相互配合，进行画面显示，所以需要一个交互协议，建立他们直接的沟通桥梁。
X协议主要有X应用程序和X服务器组成，如：我需要划个圆，X应用程序告诉X服务器在屏幕的什么地方用什么颜色画一个多大的圆，而具体的"画"的动作，比如这个圆如何生成，用什么显卡的驱动程序去指挥显卡完成等等工作是由X服务器来完成的.
X服务器还负责捕捉键盘和鼠标的动作，假设X服务器捕捉到鼠标的左键被按下了，他就告诉X应用程序:亲爱的应用程序先生，我发现鼠标被按下了，您有什么指示吗?如果X应用程序被设计成当按下鼠标左健后再在屏幕上画一个正方形的话，X应用程序就对X服务器说：请再画一个正方形，当然他会告诉服务器在什么地方用什么颜色画多大的正方形，但不关心具体怎么画——那是服务器的事情。
三、X和XFree86的关系
有了协议，就需要具体的软件来实现这个协议，就好比我们有了交通法规就需要交警去根据法规维护交通秩序一样。Xfree86就是这样一个去根据法规实现协议的"交警"，他按照X协议的规定来完成X应用程序提交的在屏幕上显示的任务.当然不仅仅是某个特定的交警才可以去维护和实现这个法规，比如还可以由交通协管员来实现交通法规，必要的时候警察也可以介入，当然前提是他们都要懂得交通法规，也就是要懂得协议，所以实现X协议的软件也并不只有XFree86，XFree86只是实现X协议的一个免费X服务器软件。商业上常用MOTIF，现在还有XORG，还有很多很小的由爱好者写的小的X服务器软件，甚至可以在Windows上有X服务器运行，这样你可以在linux系统上运行一个X应用程序然后在另一台windows系统上显示，多么神奇！你可以用google找到这样的X服务器软件，只不过在LINUX上最常用的是XFree86(现在的linux发行版都用Xorg了)顺便说一句，苹果电脑的图形界面用的也是X协议，而且被认为是做的最好的X协议图形界面，并且他对X协议的实施是做在系统内核里的，所以性能明显好很多，这就是为什么很多大型三维图形设计软件都是在苹果平台上的原因。
为了便于理解拿HTTP协议来比较:
1）协议是HTTP(hyper text transmission protocol)
实现这个协议的常用服务器有：apacheIIS 等
请求这些服务器传输文件的客户有：IE、MOZILLA、NETSCAPE等
2）协议是X
实现这个协议的常用服务器有：Xfree86、Xorg、Xnest等
请求这些服务器来完成显示任务的客户：所有的X应用程序.
只不过HTTP协议的服务器和客户端通常都在两台不同的电脑(服务器和客户机)之间来实现，所以一般人对这个比较容易理解。而X协议的服务器和客户端程序通常在同一台电脑上，因此很多用户都感到对此很难理解，既然是协议，那么肯定和平台无关的，因此可以让X应用程序显示在任何装有X服务器的远程计算机上，甚至显示在装有Xnest服务器的windows系统上。只不过在大多数情况下，X应用程序都用本机的X服务器，然后X服务器将显示结果输出到本机的显示器，这也是很多人不理解X是一种协议的原因.
四、X、X11、X11R6又是什么关系?
不知道初学者有没有注意到/usr/X11R6这个目录，这是XFree的默认安装目录
X11R6实际上是XProtocol version 11 Release6(X协议第11版第六次发行)的意思，就是说目前用的X协议是第11版的，然后经过了6次小的修正。不同版本的X协议是不能通信的，就象我们现在IPV4和IPV6不能通信一样，不过不用担心，现在的X服务器软件和X应用程序都遵循X11R6.
另外XFree86 3.3.6、XFree86 4.3.6等这些版本是实现X协议的软件XFree86的版本号.这是初学者经常高混淆的概念.
协议版本和实现协议的软件的版本——这两个概念的区别你分清楚了吗?
五、WM（Window Manager）窗口管理器
窗口管理器的作用就是实现窗口的最大化、最小化、移动、关闭等，而这些不是X服务器来负责完成的。如果不窗口管理器，X应用程序仍可以启动，但它就在屏幕中间，不能移动、不能最小化、不能最大化、没有边框。
Xfree86自带了一个简单的窗口管理器：twm，同时窗口管理器还有GNOME和KDE等。为了更方便的了解窗口管理器的作用，我们可以做以下测试(因我使用的是ubuntu，无法确认以下操作和命令的正确性，请有条件的朋友测试以下并给与指正)。
1、系统(有界面的Linux)启动后，进入图形进面，我们打开一个XTERM，输入init3就可以安全的回到字符界面.
2、再输入#startx又返回到图形界面，你看到的是一个和平时使用一样的完整的图形界面操作环境，你可以最大化、最小化、移动、关闭窗口等。
3、我们还是再次进入字符界面，按ctrl+alt+backspace反回字符界面，输入:#xinit(注：与第二步的命令startx不同)，再次启动图形界面，你看到了什么，你看到一个XTERM.而且不能移动.但是你可以在这个XTERM中输入命令打开X应用程序，如果我输入:#mozilla。打开浏览器，你看到的浏览器和平时有什么不同吗?他在屏幕中间，不能移动、不能最小化、不能最大化、没有边框。
为什么同样一个X应用程序会有这样的不同呢?因为我们用startx启动图形界面的时候同时也启动了一个默认的WM(即窗口管理器)，如果你用KDE就起动了KDE，如果你用GNOME就起动了GNOME，但是你用xinit起动图形界面的时候却没有起动WM.
4、如果你用xinit起动图形界面并在xterm中输入twm，看看会有什么?xterm被加上了一个边框，你可以通过这个边框移动、最大化、最小化这个xterm，twm就是XFree86中自带的窗口管理器，是一个比较简陋的最简单的窗口管理器，但是他具有窗口管理器的全部特征.
5、如果你不输入twm而输入gnome-session就可以起动GNOME或者输入startkde起动KDE.
通过以上的实验你就可以清楚的明白他们之间的关系，另其它的小型窗口管理器有:
windowmaker、after step、blackbox、fvwm、fvwm2等等都是常用的优秀窗口管理器。REDHAT9中有windowmaker 但是默认不安装，大家可以装来试试.只要xinit再wmaker&就可以用windowmaker了.
六、X协议的Client端有时谁实现的呢？
XFree86是X协议的服务器软件(注以软件的形式实现)，但Client端更多的是方便程序员更方便的使用X协议与服务器端的XFree86交互，故就产生了一个Xlib库，封装了X协议内容，如果你还觉得直接使用Xlib不方便，于是就产生了QT和GTK，对Xlib进一步封装，提供了很多控件，可以可视化的使用X协议更方便程序员的开发。
Xlib、QT、GTK直接关系如下图：
QT是直接使用xlib库的，GTK不能直接使用xlib，而是使用更低层的函数库GDK和Glib。这种结构使得Gtk可以更方便地移植到其它系统上，或使用与XWindows系统无关的图形库。
七、KDE、GNOME、QT和GTK直接关系
KDE和GNOME是窗口管理器，启动他们后我们进入了可视化操作(图形界面)，既然需要显示图形，自然少不了与X协议的服务器软件打交道，既然QT和GTK进一步封装了X协议，并且他们提供了更为丰富的窗口及控制机制，于是在QT基础上实现的窗口管理器叫KDE，在GTK基础上实现的窗口管理器叫GNOME.
再次提示：KDE和GNOME并不只是窗口管理器，同时提供了桌面、菜单等等。
KDE和Gnome都是桌面环境中的一种，用的库不一样，可以是KDE，Gnome，还可以是XFCE、LXDE等
kde用的qt库，但是qt库不是免费的，在基于qt的软件版权上面会有一些问题。于是就有人开发出了gnome，用的是gtk库，这个库没有qt库在版权上的问题。
（qt库和gtk库就相当于windows下的MFC库）
同一个linux有不同版本的桌面，你可以都试试，就能感觉到kde和gnome的不一样了，比如 ubuntu 是gnome桌面，Kubuntu的就是kde桌面
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四大Linux图形界面赏析：KDE、Gnome、Xfce、LXDE
如果Microsoft不是加入了图形界面，Windows系列操作系统不会成功地占领计算机桌面这块高地。