要创建一个强大并且安全的 服务器必须从一开始安装的时候就注重每一个细节的安全性。新的 服务器应该安装在一个孤立的 网络中，杜绝一切可能造成 攻击的渠道，直到操作系统的防御工作完成。
在开始安装的最初的一些步骤中，你将会被要求在FAT( 文件分配表)和NTFS(新 技术 文件系统)之间做出选择。这时，你务必为所有的磁盘驱动器选择NTFS格式。FAT是为早期的操作系统设计的比较原始的 文件系统。NTFS是随着 NT的出现而出现的，它能够提供了一FAT不具备的安全 功能，包括存取控制清单(Access Control Lists 、ACL)和 文件系统日志(File System Journaling)， 文件系统日志记录对于 文件系统的任何改变。接下来，你需要安装最新的Service Pack ( SP2 )和任何可用的热门补丁 程序。虽然Service Pack中的许多补丁 程序相当老了，但是它们能够修复若干已知的能够造成威胁的 漏洞，比如拒绝服务攻击、远程代码执行和跨站点脚本。
安装完系统之后，你就可以坐下来做一些更细致的安全工作。提高Windows Server 2003免疫力最最简单的方式就是利用服务器配置向导(Server Configuration Wizard 、SCW)，它可以指导你根据网络上服务器的角色创建一个安全的策略。
SCW与配置服务向导(Configure Your Server Wizard)是不同的。SCW不安装服务器组件，但监测 端口和服务，并配置注册和审计设置。SCW并不是默认安装的，所以你必须通过控制面板的添加/删除程序窗口来添加它。选择“添加/删除Windows组件”按钮并选择“安全配置向导”，安装过程就 自动开始了。一旦安装完毕，SCW就可以从“ 管理 工具 ”中访问。
通过SCW创建的安全策略是XML文件格式的，可用于配置服务、网络安全、特定的 注册表值、审计策略，甚至如果可能的话，还能配置 IIS。通过配置界面，可以创建新的安全策略，或者编辑现有策略，并将它们 应用于网络上的其它服务器上。如果某个操作创建的策略造成了冲突或不稳定，那么你可以回滚该操作。
SCW涵盖了Windows Server 2003安全性的所有基本要素。运行该向导，首先出现的是安全配置 数据库(Security Configuration Database)，其中包含所有的角色、客户端功能、管理选项、服务和端口等等信息。SCW还包含广泛的应用知识知识库。这意味着当一个选定的服务器角色需要某个应用时---客户端功能比如自动更新或管理应用比如备份--- Windows 防火墙就会自动打开所需要的端口。当应用程序关闭时，该端口就会自动被阻塞。
网络安全设置、注册表协议以及服务器消息块(Server Message Block、SMB)签名安全增加了关键服务器功能的安全性。对外身份验证(Outbound Authentication)设置决定了连接外部 资源时所需要的验证级别。
SCW的最后一步与审计策略有关。默认情况下，Windows Server 2003只审计成功的活动，但是对于一个加强版的系统来说，成功和失败的活动都应该被审计并记入日志。一旦向导执行完成后，所创建的安全策略就保存在一个 XML中，并且立刻就能被服务器所使用，或者供日后使用，甚至还能被其它服务器使用。在服务器安装过程中没有进行第一步强化过程的服务器也能安装SCW。
从你按下服务器的电源按钮那一刻开始，直到操作启动并且所有服务都活跃之前，威胁系统的恶意行为依然有机会破坏系统。除了操作系统操作系统以外，一台健康的服务器开始启动时应该具备 密码保护的BIOS /固件。此外，就BIOS而言，服务器的开机顺序应当被正确设定，以防从未经授权的其它介质启动。
在启动 电脑后，立刻按下F2键，这样你就进入了进入BIOS设置页面。你可以使用Alt-P在BIOS的各个设置标签上来回移动。在启动顺序(Boot Order)标签页上，设置服务器启动首选项为内部 硬盘(Internal HDD)。在系统安全(Boot Order)标签页上， 硬盘密码有三种选项可供选择：Primary、Administrative 和Hard。
同样，自动运行外部介质的功能包括光碟、DVD和USB驱动器，应该被禁用。在注册表，进入路径 HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\Cdrom(或其他设备名称)下，将 Autorun的值设置为0。自动运行功能有可能自动启动便携式介质携带的恶意应用程序。这是安装特洛伊 木马(Trojan)、 后门程序(Backdoor)、键盘记录程序(KeyLogger)、窃听器(Listener)等恶意 软件的一种简单的方法(如图4所示) 。
下一道防线是有关 用户如何登录到系统。虽然身份验证的替代技术，比如生物特征识别、令牌、智能卡和一次性密码，都是可以用于Windows Server 2003用来保护系统，但是很多系统管理员，无论是本地的还是远程的，都使用 用户名和密码的组合作为登陆服务器的验证码。不过很多时候，他们都是使用缺省密码，这显然是自找麻烦 。
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